泉州市儲備糧糧油管理有限公司共設立6個內設職能部門，27個崗位，共計42名工作人員（不含領導班子成員）。機構設置分別為綜合辦公室、計劃財務部、安全與信息設備部、倉儲管理部、業(yè)務管理部、質量檢驗部等6個職能部門。其中：

（一）綜合辦公室6名：設綜合辦公室主任1名、副主任1名、行政人事主辦1名、黨群紀檢專員1名、行政專員1名、統(tǒng)計專員1名。

（二）計劃財務部4名：設計劃財務部經理1名、會計主辦1名、會計專員1名、出納1名。

（三）安全與信息設備部4名：設安全與信息設備部經理1名、安全主辦1名、市場信息管理專員1名、水電機修員1名。

（四）倉儲管理部21名：設倉儲管理部經理1名、副經理2名、保管主辦3名、防治專員1名、保管專員12名、助理保管員2名。

（五）業(yè)務管理部4名：設業(yè)務管理部經理1名、業(yè)務主辦1名、司磅員1名、物資倉庫管理員1名。

（六）質量檢驗部3名：設質量檢驗部經理1名、檢驗主辦1名，檢驗員1名。